Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNMA1Q12791 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNMA1Q12791 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNMA1Q12791 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNMA1Q12791 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
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