Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CGNL1Q0VF96 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CGNL1Q0VF96 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CGNL1Q0VF96 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CGNL1Q0VF96 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CGNL1Q0VF96 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CGNL1Q0VF96 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CGNL1Q0VF96 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CGNL1Q0VF96 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CGNL1Q0VF96 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CGNL1Q0VF96 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
CGNL1Q0VF96 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CGNL1Q0VF96 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CGNL1Q0VF96 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CGNL1Q0VF96 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CGNL1Q0VF96 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CGNL1Q0VF96 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CGNL1Q0VF96 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CGNL1Q0VF96 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CGNL1Q0VF96 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CGNL1Q0VF96 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CGNL1Q0VF96 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CGNL1Q0VF96 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CGNL1Q0VF96 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CGNL1Q0VF96 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CGNL1Q0VF96 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
CGNL1Q0VF96 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CGNL1Q0VF96 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms