Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DSC1Q08554 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DSC1Q08554 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSC1Q08554 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms