Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
GOLGA3Q08378 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
GOLGA3Q08378 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
GOLGA3Q08378 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
GOLGA3Q08378 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
GOLGA3Q08378 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
GOLGA3Q08378 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
GOLGA3Q08378 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
GOLGA3Q08378 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
GOLGA3Q08378 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC39.23■■■■□ 3.87
GOLGA3Q08378 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
GOLGA3Q08378 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
GOLGA3Q08378 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
GOLGA3Q08378 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
GOLGA3Q08378 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
GOLGA3Q08378 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
GOLGA3Q08378 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
GOLGA3Q08378 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
GOLGA3Q08378 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
GOLGA3Q08378 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
GOLGA3Q08378 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
GOLGA3Q08378 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
GOLGA3Q08378 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
GOLGA3Q08378 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
GOLGA3Q08378 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
GOLGA3Q08378 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
GOLGA3Q08378 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
GOLGA3Q08378 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
GOLGA3Q08378 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
GOLGA3Q08378 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
GOLGA3Q08378 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
GOLGA3Q08378 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
GOLGA3Q08378 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
GOLGA3Q08378 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
GOLGA3Q08378 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
GOLGA3Q08378 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
GOLGA3Q08378 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
GOLGA3Q08378 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
GOLGA3Q08378 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
GOLGA3Q08378 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
GOLGA3Q08378 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC39.11■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.85
GOLGA3Q08378 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
GOLGA3Q08378 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
GOLGA3Q08378 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
GOLGA3Q08378 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
GOLGA3Q08378 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
GOLGA3Q08378 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
GOLGA3Q08378 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
GOLGA3Q08378 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
GOLGA3Q08378 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
GOLGA3Q08378 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
GOLGA3Q08378 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
GOLGA3Q08378 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
GOLGA3Q08378 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
GOLGA3Q08378 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
GOLGA3Q08378 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
GOLGA3Q08378 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
GOLGA3Q08378 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
GOLGA3Q08378 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
GOLGA3Q08378 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
GOLGA3Q08378 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
GOLGA3Q08378 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
GOLGA3Q08378 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
GOLGA3Q08378 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
GOLGA3Q08378 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
GOLGA3Q08378 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
GOLGA3Q08378 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms