Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LRP1Q07954 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LRP1Q07954 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LRP1Q07954 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LRP1Q07954 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
LRP1Q07954 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LRP1Q07954 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LRP1Q07954 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LRP1Q07954 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LRP1Q07954 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LRP1Q07954 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LRP1Q07954 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LRP1Q07954 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRP1Q07954 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRP1Q07954 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRP1Q07954 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRP1Q07954 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRP1Q07954 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
LRP1Q07954 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRP1Q07954 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRP1Q07954 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LRP1Q07954 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRP1Q07954 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRP1Q07954 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRP1Q07954 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRP1Q07954 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRP1Q07954 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRP1Q07954 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
LRP1Q07954 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LRP1Q07954 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms