Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 RPS2YGL123W 765 nt5.51□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 YKL223WYKL223W 333 nt5.51□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 TSR2YLR435W 618 nt5.51□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 POR1YNL055C 852 nt5.51□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 CYS4YGR155W 1524 nt5.51□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 MPH3YJR160C 1809 nt5.51□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 VPS70YJR126C 2436 nt5.5□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 SSK22YCR073C 3996 nt5.5□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 GSY2YLR258W 2118 nt5.5□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 TIM22YDL217C 624 nt5.5□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 CDC34YDR054C 888 nt5.5□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 SDH4YDR178W 546 nt5.5□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 SCS7YMR272C 1155 nt5.5□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 MRPS16YPL013C 366 nt5.5□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 ASN1YPR145W 1719 nt5.5□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 GPB2YAL056W 2643 nt5.5□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 GEX1YCL073C 1848 nt5.5□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 GEX2YKR106W 1848 nt5.5□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 GPT2YKR067W 2232 nt5.5□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 RIM101YHL027W 1878 nt5.49□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 SIP2YGL208W 1248 nt5.49□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 ATG4YNL223W 1485 nt5.49□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 YLR317WYLR317W 435 nt5.48□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 PKC1YBL105C 3456 nt5.48□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 MID1YNL291C 1647 nt5.48□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 DIA3YDL024C 1407 nt5.48□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 HSP104YLL026W 2727 nt5.47□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 POX1YGL205W 2247 nt5.47□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 YKR023WYKR023W 1593 nt5.47□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 ENT2YLR206W 1842 nt5.47□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 HAP3YBL021C 435 nt5.47□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 MDM31YHR194W 1740 nt5.47□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.47□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 CRF1YDR223W 1404 nt5.47□□□□□ -1.53
NEJ1Q06148 ACC1YNR016C 6702 nt5.46□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 GEP5YLR091W 882 nt5.46□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 YBR027CYBR027C 333 nt5.46□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 HSF1YGL073W 2502 nt5.46□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt5.45□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 CWC21YDR482C 408 nt5.45□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 PAP2YOL115W 1755 nt5.44□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 YET3YDL072C 612 nt5.44□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 VCX1YDL128W 1236 nt5.44□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 RVB2YPL235W 1416 nt5.44□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 SCT1YBL011W 2280 nt5.44□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 RNR3YIL066C 2610 nt5.44□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 QDR3YBR043C 2070 nt5.43□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 ASH1YKL185W 1767 nt5.43□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 ALT1YLR089C 1779 nt5.43□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 STM1YLR150W 822 nt5.43□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 GUP2YPL189W 1830 nt5.43□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 KSS1YGR040W 1107 nt5.42□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 RHO2YNL090W 579 nt5.42□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 SSK1YLR006C 2139 nt5.42□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 GIT1YCR098C 1557 nt5.42□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.41□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.41□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.41□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 RRT2YBR246W 1164 nt5.41□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 SET5YHR207C 1581 nt5.41□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 FLC3YGL139W 2409 nt5.4□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 MAK31YCR020C-A 267 nt5.4□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 CUP2YGL166W 678 nt5.4□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 PHB1YGR132C 864 nt5.4□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 SPG1YGR236C 288 nt5.4□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 ASK1YKL052C 879 nt5.4□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 ILV6YCL009C 930 nt5.4□□□□□ -1.54
NEJ1Q06148 CLP1YOR250C 1338 nt5.4□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.4□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 SMF2YHR050W 1650 nt5.4□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 GYP1YOR070C 1914 nt5.39□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 RAD24YER173W 1980 nt5.39□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 YDL218WYDL218W 954 nt5.39□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 DJP1YIR004W 1299 nt5.39□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 SFC1YJR095W 969 nt5.39□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 RHO4YKR055W 876 nt5.39□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 YLR296WYLR296W 327 nt5.39□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 HOR7YMR251W-A 180 nt5.39□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 ICL1YER065C 1674 nt5.39□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 ERG7YHR072W 2196 nt5.39□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 YIR007WYIR007W 2295 nt5.39□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 RFA1YAR007C 1866 nt5.39□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt5.38□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 NPA3YJR072C 1158 nt5.38□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 GFD1YMR255W 567 nt5.38□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 PSH1YOL054W 1221 nt5.38□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 RET1YOR207C 3450 nt5.38□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 YPR196WYPR196W 1413 nt5.38□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 HEM3YDL205C 984 nt5.37□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 SNZ3YFL059W 897 nt5.37□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 MPC2YHR162W 390 nt5.37□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 LYS12YIL094C 1116 nt5.37□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 VPS24YKL041W 675 nt5.37□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 SNZ2YNL333W 897 nt5.37□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 RDL2YOR286W 450 nt5.37□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 RBD2YPL246C 789 nt5.37□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 VNX1YNL321W 2727 nt5.37□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 GUF1YLR289W 1938 nt5.36□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 MSN2YMR037C 2115 nt5.36□□□□□ -1.55
NEJ1Q06148 VTC2YFL004W 2487 nt5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.1 ms