Protein–RNA interactions for Protein: Q04304

YMR090W, UPF0659 protein YMR090W, yeast

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR090W	Q04304	CWC27	YPL064C	906 nt		4.93	□□□□□ -1.62
YMR090W	Q04304	YPR196W	YPR196W	1413 nt		4.93	□□□□□ -1.62
YMR090W	Q04304	MCM6	YGL201C	3054 nt		4.93	□□□□□ -1.62
YMR090W	Q04304	SFB3	YHR098C	2790 nt		4.93	□□□□□ -1.62
YMR090W	Q04304	DIA3	YDL024C	1407 nt		4.92	□□□□□ -1.62
YMR090W	Q04304	YDR187C	YDR187C	519 nt		4.92	□□□□□ -1.62
YMR090W	Q04304	MPC2	YHR162W	390 nt		4.92	□□□□□ -1.62
YMR090W	Q04304	EPS1	YIL005W	2106 nt		4.92	□□□□□ -1.62
YMR090W	Q04304	GEP5	YLR091W	882 nt		4.92	□□□□□ -1.62
YMR090W	Q04304	CPA1	YOR303W	1236 nt		4.92	□□□□□ -1.62
YMR090W	Q04304	TAE1	YBR261C	699 nt		4.92	□□□□□ -1.62
YMR090W	Q04304	MID1	YNL291C	1647 nt		4.92	□□□□□ -1.62
YMR090W	Q04304	GPA2	YER020W	1350 nt		4.91	□□□□□ -1.62
YMR090W	Q04304	SUP19	tS(UGA)E	82 nt		4.91	□□□□□ -1.62
YMR090W	Q04304	SUP17	tS(UGA)I	82 nt		4.91	□□□□□ -1.62
YMR090W	Q04304	SUP16	tS(UGA)P	82 nt		4.91	□□□□□ -1.62
YMR090W	Q04304	STM1	YLR150W	822 nt		4.91	□□□□□ -1.62
YMR090W	Q04304	YLR317W	YLR317W	435 nt		4.91	□□□□□ -1.62
YMR090W	Q04304	MKK2	YPL140C	1521 nt		4.91	□□□□□ -1.62
YMR090W	Q04304	VPS70	YJR126C	2436 nt		4.9	□□□□□ -1.62
YMR090W	Q04304	SIP2	YGL208W	1248 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	KSS1	YGR040W	1107 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	NAS6	YGR232W	687 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	RHO4	YKR055W	876 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	YLR361C-A	YLR361C-A	297 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	POR1	YNL055C	852 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	TSR3	YOR006C	942 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	RAD24	YER173W	1980 nt		4.9	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	QDR3	YBR043C	2070 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	TIM22	YDL217C	624 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	CAF40	YNL288W	1122 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	YOR300W	YOR300W	309 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	GIT1	YCR098C	1557 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	ATF1	YOR377W	1578 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	ICL1	YER065C	1674 nt		4.89	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	YDL218W	YDL218W	954 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	ENT2	YLR206W	1842 nt		4.88	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	ATP4	YPL078C	735 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	ERG1	YGR175C	1491 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	SSK1	YLR006C	2139 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	GSY2	YLR258W	2118 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	RET1	YOR207C	3450 nt		4.87	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	RIM101	YHL027W	1878 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	YDR015C	YDR015C	240 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	TFG2	YGR005C	1203 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	PHB1	YGR132C	864 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	LYS12	YIL094C	1116 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	ASK1	YKL052C	879 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	YKL223W	YKL223W	333 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	YMR122C	YMR122C	375 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	HSF1	YGL073W	2502 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	IMA2	YOL157C	1770 nt		4.86	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	SGV1	YPR161C	1974 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	TEL2	YGR099W	2067 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	SNZ3	YFL059W	897 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	DJP1	YIR004W	1299 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	NPA3	YJR072C	1158 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	SNZ2	YNL333W	897 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	MLC2	YPR188C	492 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	ASH1	YKL185W	1767 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	STE13	YOR219C	2796 nt		4.85	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	HSP104	YLL026W	2727 nt		4.84	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	SMF2	YHR050W	1650 nt		4.84	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	MSS1	YMR023C	1581 nt		4.84	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	YDL129W	YDL129W	876 nt		4.84	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	LEU5	YHR002W	1074 nt		4.84	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	YMR252C	YMR252C	405 nt		4.84	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	RHO2	YNL090W	579 nt		4.84	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	YNL285W	YNL285W	372 nt		4.84	□□□□□ -1.63
YMR090W	Q04304	TRP5	YGL026C	2124 nt		4.84	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	TKL1	YPR074C	2043 nt		4.84	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	NSE5	YML023C	1671 nt		4.83	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	CDC1	YDR182W	1476 nt		4.83	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	VCX1	YDL128W	1236 nt		4.83	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	SPG1	YGR236C	288 nt		4.83	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	GFD1	YMR255W	567 nt		4.83	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	CRZ1	YNL027W	2037 nt		4.83	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	PKC1	YBL105C	3456 nt		4.83	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	GEX1	YCL073C	1848 nt		4.83	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	IRS4	YKR019C	1848 nt		4.83	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	GEX2	YKR106W	1848 nt		4.83	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	SCT1	YBL011W	2280 nt		4.83	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	YDR109C	YDR109C	2148 nt		4.82	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	VNX1	YNL321W	2727 nt		4.82	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	GYP1	YOR070C	1914 nt		4.82	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	YIL060W	YIL060W	435 nt		4.82	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	HOR7	YMR251W-A	180 nt		4.82	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	YMR295C	YMR295C	594 nt		4.82	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	YNL042W-B	YNL042W-B	258 nt		4.82	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	RRT2	YBR246W	1164 nt		4.82	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	OSW2	YLR054C	2175 nt		4.82	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	YML082W	YML082W	1950 nt		4.82	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	CWC21	YDR482C	408 nt		4.81	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	MSP1	YGR028W	1089 nt		4.81	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	TDH2	YJR009C	999 nt		4.81	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	JNM1	YMR294W	1122 nt		4.81	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	RBD2	YPL246C	789 nt		4.81	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	APE3	YBR286W	1614 nt		4.81	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	GFA1	YKL104C	2154 nt		4.81	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	ALT1	YLR089C	1779 nt		4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.6 ms