Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAV1Q03135 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAV1Q03135 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAV1Q03135 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.3 ms