Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNB1Q02641 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNB1Q02641 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNB1Q02641 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms