Protein–RNA interactions for Protein: Q02543

RPL18A, 60S ribosomal protein L18a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18AQ02543 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL18AQ02543 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL18AQ02543 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms