Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A3Q01959 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC6A3Q01959 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC6A3Q01959 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC6A3Q01959 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC6A3Q01959 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC6A3Q01959 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC6A3Q01959 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC6A3Q01959 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC6A3Q01959 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms