Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPIBQ01892 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SPIBQ01892 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPIBQ01892 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms