Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EXOSC10Q01780 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EXOSC10Q01780 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EXOSC10Q01780 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms