Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MC1RQ01726 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MC1RQ01726 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MC1RQ01726 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms