Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SPTBN1Q01082 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SPTBN1Q01082 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPTBN1Q01082 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms