Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBP5P82980 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBP5P82980 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBP5P82980 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBP5P82980 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBP5P82980 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBP5P82980 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RBP5P82980 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBP5P82980 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBP5P82980 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBP5P82980 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBP5P82980 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBP5P82980 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBP5P82980 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RBP5P82980 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBP5P82980 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBP5P82980 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBP5P82980 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBP5P82980 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBP5P82980 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBP5P82980 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBP5P82980 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBP5P82980 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBP5P82980 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBP5P82980 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RBP5P82980 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBP5P82980 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBP5P82980 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBP5P82980 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBP5P82980 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBP5P82980 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RBP5P82980 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBP5P82980 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBP5P82980 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RBP5P82980 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBP5P82980 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBP5P82980 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBP5P82980 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBP5P82980 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBP5P82980 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBP5P82980 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBP5P82980 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBP5P82980 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RBP5P82980 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBP5P82980 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBP5P82980 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBP5P82980 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBP5P82980 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBP5P82980 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RBP5P82980 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBP5P82980 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBP5P82980 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBP5P82980 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBP5P82980 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBP5P82980 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBP5P82980 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBP5P82980 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBP5P82980 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBP5P82980 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBP5P82980 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBP5P82980 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBP5P82980 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RBP5P82980 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RBP5P82980 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RBP5P82980 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RBP5P82980 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RBP5P82980 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RBP5P82980 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RBP5P82980 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RBP5P82980 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RBP5P82980 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RBP5P82980 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RBP5P82980 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBP5P82980 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RBP5P82980 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBP5P82980 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBP5P82980 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBP5P82980 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBP5P82980 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBP5P82980 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBP5P82980 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBP5P82980 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBP5P82980 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBP5P82980 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBP5P82980 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBP5P82980 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBP5P82980 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBP5P82980 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBP5P82980 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBP5P82980 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBP5P82980 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBP5P82980 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBP5P82980 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBP5P82980 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBP5P82980 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBP5P82980 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBP5P82980 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBP5P82980 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBP5P82980 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBP5P82980 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms