Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTA1P68133 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTA1P68133 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms