Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNRPD1P62314 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNRPD1P62314 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPD1P62314 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms