Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNRPFP62306 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNRPFP62306 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SNRPFP62306 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNRPFP62306 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNRPFP62306 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNRPFP62306 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNRPFP62306 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNRPFP62306 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNRPFP62306 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNRPFP62306 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNRPFP62306 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNRPFP62306 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNRPFP62306 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNRPFP62306 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNRPFP62306 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNRPFP62306 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNRPFP62306 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SNRPFP62306 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SNRPFP62306 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRPFP62306 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRPFP62306 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRPFP62306 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRPFP62306 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRPFP62306 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRPFP62306 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRPFP62306 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNRPFP62306 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SNRPFP62306 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms