Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP46P62068 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP46P62068 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP46P62068 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP46P62068 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP46P62068 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP46P62068 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP46P62068 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP46P62068 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP46P62068 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP46P62068 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP46P62068 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP46P62068 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP46P62068 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP46P62068 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP46P62068 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP46P62068 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP46P62068 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP46P62068 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP46P62068 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP46P62068 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP46P62068 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP46P62068 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP46P62068 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP46P62068 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP46P62068 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP46P62068 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP46P62068 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP46P62068 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP46P62068 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP46P62068 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP46P62068 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP46P62068 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP46P62068 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP46P62068 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP46P62068 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP46P62068 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP46P62068 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP46P62068 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP46P62068 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP46P62068 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP46P62068 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP46P62068 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP46P62068 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP46P62068 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP46P62068 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP46P62068 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP46P62068 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP46P62068 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP46P62068 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP46P62068 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP46P62068 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP46P62068 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP46P62068 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP46P62068 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP46P62068 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP46P62068 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP46P62068 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP46P62068 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP46P62068 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP46P62068 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP46P62068 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP46P62068 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP46P62068 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP46P62068 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP46P62068 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP46P62068 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP46P62068 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP46P62068 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP46P62068 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP46P62068 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP46P62068 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP46P62068 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP46P62068 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP46P62068 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP46P62068 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP46P62068 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP46P62068 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP46P62068 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
USP46P62068 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP46P62068 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP46P62068 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP46P62068 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP46P62068 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP46P62068 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP46P62068 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP46P62068 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP46P62068 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP46P62068 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP46P62068 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP46P62068 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP46P62068 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP46P62068 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP46P62068 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP46P62068 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP46P62068 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP46P62068 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP46P62068 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP46P62068 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP46P62068 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
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