Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UFM1P61960 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFM1P61960 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFM1P61960 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFM1P61960 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFM1P61960 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFM1P61960 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFM1P61960 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFM1P61960 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFM1P61960 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UFM1P61960 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UFM1P61960 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UFM1P61960 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UFM1P61960 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UFM1P61960 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UFM1P61960 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UFM1P61960 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UFM1P61960 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFM1P61960 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFM1P61960 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFM1P61960 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFM1P61960 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFM1P61960 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFM1P61960 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFM1P61960 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UFM1P61960 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFM1P61960 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UFM1P61960 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFM1P61960 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFM1P61960 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFM1P61960 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFM1P61960 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFM1P61960 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UFM1P61960 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFM1P61960 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFM1P61960 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFM1P61960 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFM1P61960 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UFM1P61960 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UFM1P61960 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UFM1P61960 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UFM1P61960 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UFM1P61960 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UFM1P61960 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UFM1P61960 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UFM1P61960 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UFM1P61960 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UFM1P61960 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UFM1P61960 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UFM1P61960 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UFM1P61960 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UFM1P61960 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UFM1P61960 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UFM1P61960 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UFM1P61960 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UFM1P61960 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UFM1P61960 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UFM1P61960 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UFM1P61960 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UFM1P61960 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UFM1P61960 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UFM1P61960 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UFM1P61960 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UFM1P61960 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UFM1P61960 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UFM1P61960 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UFM1P61960 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UFM1P61960 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
UFM1P61960 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UFM1P61960 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UFM1P61960 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UFM1P61960 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UFM1P61960 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UFM1P61960 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UFM1P61960 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UFM1P61960 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UFM1P61960 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UFM1P61960 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UFM1P61960 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UFM1P61960 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UFM1P61960 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UFM1P61960 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UFM1P61960 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UFM1P61960 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UFM1P61960 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UFM1P61960 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UFM1P61960 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UFM1P61960 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UFM1P61960 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UFM1P61960 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UFM1P61960 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UFM1P61960 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UFM1P61960 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UFM1P61960 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UFM1P61960 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UFM1P61960 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UFM1P61960 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UFM1P61960 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UFM1P61960 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UFM1P61960 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms