Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOAP61586 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOAP61586 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOAP61586 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOAP61586 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOAP61586 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOAP61586 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOAP61586 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOAP61586 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOAP61586 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOAP61586 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOAP61586 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOAP61586 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOAP61586 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOAP61586 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOAP61586 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOAP61586 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOAP61586 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOAP61586 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOAP61586 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOAP61586 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOAP61586 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOAP61586 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOAP61586 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOAP61586 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOAP61586 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOAP61586 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOAP61586 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOAP61586 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOAP61586 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOAP61586 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOAP61586 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOAP61586 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOAP61586 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOAP61586 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOAP61586 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOAP61586 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOAP61586 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOAP61586 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOAP61586 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOAP61586 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOAP61586 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOAP61586 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOAP61586 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOAP61586 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOAP61586 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOAP61586 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOAP61586 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOAP61586 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOAP61586 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOAP61586 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOAP61586 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOAP61586 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOAP61586 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOAP61586 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOAP61586 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOAP61586 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOAP61586 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOAP61586 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOAP61586 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOAP61586 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOAP61586 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOAP61586 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOAP61586 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOAP61586 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOAP61586 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RHOAP61586 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RHOAP61586 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOAP61586 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOAP61586 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOAP61586 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOAP61586 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOAP61586 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOAP61586 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOAP61586 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOAP61586 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOAP61586 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOAP61586 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOAP61586 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOAP61586 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOAP61586 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOAP61586 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOAP61586 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOAP61586 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOAP61586 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOAP61586 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOAP61586 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOAP61586 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOAP61586 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOAP61586 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOAP61586 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOAP61586 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOAP61586 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOAP61586 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOAP61586 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOAP61586 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOAP61586 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOAP61586 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOAP61586 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOAP61586 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms