Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERVK-21P61565 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERVK-21P61565 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVK-21P61565 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVK-21P61565 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms