Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE2MP61081 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE2MP61081 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UBE2MP61081 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2MP61081 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UBE2MP61081 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms