Protein–RNA interactions for Protein: P61006

RAB8A, Ras-related protein Rab-8A, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB8AP61006 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB8AP61006 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB8AP61006 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms