Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ROMO1P60602 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms