Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSX2P58304 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSX2P58304 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSX2P58304 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSX2P58304 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSX2P58304 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSX2P58304 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSX2P58304 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSX2P58304 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSX2P58304 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSX2P58304 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSX2P58304 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSX2P58304 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSX2P58304 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSX2P58304 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSX2P58304 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSX2P58304 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSX2P58304 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSX2P58304 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSX2P58304 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSX2P58304 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSX2P58304 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSX2P58304 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSX2P58304 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSX2P58304 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSX2P58304 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSX2P58304 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSX2P58304 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VSX2P58304 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSX2P58304 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VSX2P58304 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VSX2P58304 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VSX2P58304 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSX2P58304 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSX2P58304 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSX2P58304 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSX2P58304 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSX2P58304 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSX2P58304 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VSX2P58304 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSX2P58304 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSX2P58304 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSX2P58304 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSX2P58304 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSX2P58304 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSX2P58304 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSX2P58304 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSX2P58304 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSX2P58304 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSX2P58304 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VSX2P58304 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSX2P58304 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSX2P58304 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSX2P58304 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSX2P58304 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VSX2P58304 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSX2P58304 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSX2P58304 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VSX2P58304 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSX2P58304 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSX2P58304 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSX2P58304 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSX2P58304 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSX2P58304 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSX2P58304 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VSX2P58304 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSX2P58304 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSX2P58304 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSX2P58304 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSX2P58304 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VSX2P58304 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSX2P58304 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSX2P58304 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VSX2P58304 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSX2P58304 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSX2P58304 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VSX2P58304 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSX2P58304 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSX2P58304 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSX2P58304 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSX2P58304 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VSX2P58304 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
VSX2P58304 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSX2P58304 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSX2P58304 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSX2P58304 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSX2P58304 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSX2P58304 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSX2P58304 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSX2P58304 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSX2P58304 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSX2P58304 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSX2P58304 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSX2P58304 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VSX2P58304 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSX2P58304 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSX2P58304 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSX2P58304 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSX2P58304 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VSX2P58304 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms