Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SOX10P56693 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SOX10P56693 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SOX10P56693 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SOX10P56693 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SOX10P56693 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SOX10P56693 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SOX10P56693 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SOX10P56693 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SOX10P56693 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SOX10P56693 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SOX10P56693 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SOX10P56693 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SOX10P56693 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SOX10P56693 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SOX10P56693 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SOX10P56693 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SOX10P56693 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SOX10P56693 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SOX10P56693 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SOX10P56693 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SOX10P56693 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SOX10P56693 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SOX10P56693 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SOX10P56693 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SOX10P56693 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SOX10P56693 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SOX10P56693 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SOX10P56693 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SOX10P56693 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SOX10P56693 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SOX10P56693 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SOX10P56693 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SOX10P56693 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SOX10P56693 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SOX10P56693 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SOX10P56693 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SOX10P56693 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SOX10P56693 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SOX10P56693 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SOX10P56693 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SOX10P56693 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SOX10P56693 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SOX10P56693 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SOX10P56693 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SOX10P56693 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SOX10P56693 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SOX10P56693 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SOX10P56693 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SOX10P56693 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SOX10P56693 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SOX10P56693 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOX10P56693 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOX10P56693 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOX10P56693 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOX10P56693 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOX10P56693 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX10P56693 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX10P56693 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX10P56693 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX10P56693 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX10P56693 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX10P56693 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX10P56693 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SOX10P56693 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SOX10P56693 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SOX10P56693 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SOX10P56693 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SOX10P56693 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX10P56693 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX10P56693 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX10P56693 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX10P56693 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX10P56693 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX10P56693 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX10P56693 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX10P56693 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX10P56693 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX10P56693 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX10P56693 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX10P56693 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX10P56693 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX10P56693 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX10P56693 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX10P56693 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX10P56693 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX10P56693 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX10P56693 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX10P56693 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX10P56693 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX10P56693 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX10P56693 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX10P56693 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX10P56693 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX10P56693 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX10P56693 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX10P56693 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SOX10P56693 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SOX10P56693 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SOX10P56693 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms