Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SH3BGRP55822 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3BGRP55822 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BGRP55822 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms