Protein–RNA interactions for Protein: P55290

CDH13, Cadherin-13, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH13P55290 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH13P55290 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH13P55290 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH13P55290 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH13P55290 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH13P55290 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH13P55290 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH13P55290 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH13P55290 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH13P55290 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH13P55290 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH13P55290 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH13P55290 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH13P55290 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH13P55290 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH13P55290 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH13P55290 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH13P55290 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH13P55290 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH13P55290 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH13P55290 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH13P55290 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH13P55290 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH13P55290 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH13P55290 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH13P55290 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH13P55290 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH13P55290 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH13P55290 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CDH13P55290 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH13P55290 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH13P55290 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH13P55290 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH13P55290 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH13P55290 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH13P55290 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH13P55290 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH13P55290 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH13P55290 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH13P55290 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH13P55290 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH13P55290 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH13P55290 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH13P55290 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH13P55290 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH13P55290 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH13P55290 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH13P55290 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH13P55290 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH13P55290 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH13P55290 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH13P55290 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH13P55290 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH13P55290 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH13P55290 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH13P55290 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH13P55290 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH13P55290 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH13P55290 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH13P55290 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH13P55290 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH13P55290 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH13P55290 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH13P55290 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH13P55290 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH13P55290 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH13P55290 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH13P55290 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH13P55290 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CDH13P55290 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH13P55290 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH13P55290 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH13P55290 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH13P55290 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH13P55290 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH13P55290 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH13P55290 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH13P55290 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH13P55290 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH13P55290 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH13P55290 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH13P55290 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH13P55290 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH13P55290 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH13P55290 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH13P55290 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH13P55290 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH13P55290 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH13P55290 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH13P55290 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH13P55290 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH13P55290 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH13P55290 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH13P55290 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH13P55290 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH13P55290 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH13P55290 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH13P55290 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH13P55290 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH13P55290 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms