Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
RAD23BP54727 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD23BP54727 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD23BP54727 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD23BP54727 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms