Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP12AP54707 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP12AP54707 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP12AP54707 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP12AP54707 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms