Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YARSP54577 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YARSP54577 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YARSP54577 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YARSP54577 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YARSP54577 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
YARSP54577 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YARSP54577 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YARSP54577 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
YARSP54577 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
YARSP54577 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YARSP54577 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
YARSP54577 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26■■□□□ 1.75
YARSP54577 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
YARSP54577 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YARSP54577 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YARSP54577 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YARSP54577 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
YARSP54577 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YARSP54577 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YARSP54577 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YARSP54577 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YARSP54577 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YARSP54577 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
YARSP54577 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YARSP54577 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YARSP54577 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YARSP54577 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YARSP54577 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YARSP54577 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
YARSP54577 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
YARSP54577 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
YARSP54577 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
YARSP54577 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
YARSP54577 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
YARSP54577 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
YARSP54577 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
YARSP54577 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
YARSP54577 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
YARSP54577 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
YARSP54577 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
YARSP54577 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
YARSP54577 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
YARSP54577 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
YARSP54577 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
YARSP54577 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
YARSP54577 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
YARSP54577 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
YARSP54577 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
YARSP54577 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
YARSP54577 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
YARSP54577 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
YARSP54577 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YARSP54577 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YARSP54577 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
YARSP54577 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
YARSP54577 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
YARSP54577 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YARSP54577 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
YARSP54577 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YARSP54577 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YARSP54577 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
YARSP54577 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YARSP54577 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
YARSP54577 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
YARSP54577 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
YARSP54577 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YARSP54577 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YARSP54577 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YARSP54577 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YARSP54577 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
YARSP54577 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YARSP54577 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YARSP54577 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
YARSP54577 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YARSP54577 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
YARSP54577 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YARSP54577 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
YARSP54577 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
YARSP54577 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YARSP54577 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YARSP54577 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
YARSP54577 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
YARSP54577 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
YARSP54577 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
YARSP54577 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
YARSP54577 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
YARSP54577 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
YARSP54577 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
YARSP54577 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
YARSP54577 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
YARSP54577 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YARSP54577 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YARSP54577 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YARSP54577 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
YARSP54577 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
YARSP54577 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YARSP54577 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
YARSP54577 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YARSP54577 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms