Protein–RNA interactions for Protein: P53634

CTSC, Dipeptidyl peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSCP53634 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSCP53634 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSCP53634 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSCP53634 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTSCP53634 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSCP53634 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSCP53634 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSCP53634 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSCP53634 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSCP53634 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSCP53634 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSCP53634 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTSCP53634 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTSCP53634 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTSCP53634 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTSCP53634 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTSCP53634 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSCP53634 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSCP53634 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSCP53634 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSCP53634 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSCP53634 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSCP53634 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSCP53634 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSCP53634 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSCP53634 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSCP53634 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSCP53634 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSCP53634 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSCP53634 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSCP53634 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSCP53634 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSCP53634 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSCP53634 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSCP53634 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSCP53634 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSCP53634 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSCP53634 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSCP53634 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSCP53634 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSCP53634 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSCP53634 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSCP53634 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSCP53634 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSCP53634 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSCP53634 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSCP53634 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSCP53634 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSCP53634 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CTSCP53634 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSCP53634 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSCP53634 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSCP53634 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSCP53634 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSCP53634 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSCP53634 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSCP53634 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSCP53634 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSCP53634 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSCP53634 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSCP53634 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSCP53634 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSCP53634 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSCP53634 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSCP53634 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSCP53634 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSCP53634 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSCP53634 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSCP53634 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSCP53634 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSCP53634 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSCP53634 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSCP53634 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSCP53634 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSCP53634 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSCP53634 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSCP53634 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSCP53634 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSCP53634 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSCP53634 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSCP53634 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSCP53634 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSCP53634 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSCP53634 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSCP53634 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSCP53634 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSCP53634 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSCP53634 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSCP53634 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTSCP53634 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSCP53634 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSCP53634 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSCP53634 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSCP53634 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSCP53634 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSCP53634 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSCP53634 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTSCP53634 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSCP53634 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTSCP53634 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms