Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOSBP53539 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
FOSBP53539 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
FOSBP53539 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOSBP53539 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOSBP53539 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOSBP53539 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOSBP53539 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOSBP53539 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOSBP53539 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOSBP53539 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOSBP53539 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOSBP53539 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOSBP53539 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOSBP53539 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOSBP53539 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOSBP53539 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOSBP53539 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOSBP53539 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOSBP53539 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOSBP53539 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOSBP53539 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FOSBP53539 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOSBP53539 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOSBP53539 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOSBP53539 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOSBP53539 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOSBP53539 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOSBP53539 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOSBP53539 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOSBP53539 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOSBP53539 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOSBP53539 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOSBP53539 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOSBP53539 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOSBP53539 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOSBP53539 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOSBP53539 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOSBP53539 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOSBP53539 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOSBP53539 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOSBP53539 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOSBP53539 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOSBP53539 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOSBP53539 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOSBP53539 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FOSBP53539 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FOSBP53539 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FOSBP53539 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FOSBP53539 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOSBP53539 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOSBP53539 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOSBP53539 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOSBP53539 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOSBP53539 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOSBP53539 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOSBP53539 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOSBP53539 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOSBP53539 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOSBP53539 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOSBP53539 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOSBP53539 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FOSBP53539 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOSBP53539 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOSBP53539 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOSBP53539 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOSBP53539 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOSBP53539 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOSBP53539 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOSBP53539 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FOSBP53539 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOSBP53539 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOSBP53539 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOSBP53539 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FOSBP53539 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOSBP53539 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FOSBP53539 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOSBP53539 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
FOSBP53539 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOSBP53539 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOSBP53539 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOSBP53539 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOSBP53539 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FOSBP53539 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOSBP53539 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOSBP53539 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOSBP53539 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOSBP53539 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOSBP53539 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOSBP53539 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOSBP53539 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOSBP53539 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOSBP53539 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FOSBP53539 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FOSBP53539 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FOSBP53539 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOSBP53539 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOSBP53539 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOSBP53539 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOSBP53539 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms