Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2A1P52655 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2A1P52655 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms