Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEK4P51957 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEK4P51957 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NEK4P51957 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEK4P51957 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEK4P51957 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEK4P51957 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEK4P51957 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEK4P51957 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEK4P51957 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEK4P51957 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEK4P51957 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NEK4P51957 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEK4P51957 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEK4P51957 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEK4P51957 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEK4P51957 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEK4P51957 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEK4P51957 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEK4P51957 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEK4P51957 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEK4P51957 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEK4P51957 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEK4P51957 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEK4P51957 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NEK4P51957 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEK4P51957 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEK4P51957 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEK4P51957 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEK4P51957 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEK4P51957 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
NEK4P51957 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEK4P51957 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEK4P51957 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEK4P51957 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEK4P51957 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEK4P51957 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEK4P51957 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEK4P51957 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEK4P51957 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NEK4P51957 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEK4P51957 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEK4P51957 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEK4P51957 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEK4P51957 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEK4P51957 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEK4P51957 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEK4P51957 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEK4P51957 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEK4P51957 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEK4P51957 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEK4P51957 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEK4P51957 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NEK4P51957 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEK4P51957 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEK4P51957 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEK4P51957 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEK4P51957 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEK4P51957 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEK4P51957 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEK4P51957 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEK4P51957 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEK4P51957 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEK4P51957 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEK4P51957 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEK4P51957 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEK4P51957 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEK4P51957 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEK4P51957 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEK4P51957 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEK4P51957 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEK4P51957 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEK4P51957 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEK4P51957 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEK4P51957 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEK4P51957 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEK4P51957 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEK4P51957 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEK4P51957 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEK4P51957 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEK4P51957 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEK4P51957 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEK4P51957 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEK4P51957 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEK4P51957 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NEK4P51957 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEK4P51957 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NEK4P51957 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEK4P51957 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEK4P51957 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEK4P51957 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEK4P51957 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NEK4P51957 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEK4P51957 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NEK4P51957 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEK4P51957 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEK4P51957 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEK4P51957 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEK4P51957 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEK4P51957 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms