Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6CP51160 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6CP51160 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6CP51160 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6CP51160 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6CP51160 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6CP51160 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6CP51160 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6CP51160 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6CP51160 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6CP51160 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6CP51160 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6CP51160 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE6CP51160 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE6CP51160 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE6CP51160 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE6CP51160 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6CP51160 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6CP51160 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6CP51160 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6CP51160 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6CP51160 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6CP51160 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6CP51160 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6CP51160 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6CP51160 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6CP51160 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6CP51160 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE6CP51160 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE6CP51160 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms