Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLCSP50747 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLCSP50747 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLCSP50747 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HLCSP50747 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLCSP50747 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLCSP50747 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLCSP50747 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLCSP50747 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLCSP50747 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLCSP50747 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLCSP50747 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HLCSP50747 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLCSP50747 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLCSP50747 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLCSP50747 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HLCSP50747 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLCSP50747 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLCSP50747 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLCSP50747 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLCSP50747 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLCSP50747 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLCSP50747 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLCSP50747 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLCSP50747 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLCSP50747 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLCSP50747 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLCSP50747 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HLCSP50747 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLCSP50747 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HLCSP50747 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLCSP50747 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLCSP50747 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLCSP50747 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLCSP50747 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HLCSP50747 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLCSP50747 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLCSP50747 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HLCSP50747 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HLCSP50747 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLCSP50747 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLCSP50747 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLCSP50747 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLCSP50747 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLCSP50747 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLCSP50747 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLCSP50747 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLCSP50747 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLCSP50747 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLCSP50747 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLCSP50747 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLCSP50747 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLCSP50747 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLCSP50747 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLCSP50747 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLCSP50747 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HLCSP50747 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HLCSP50747 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HLCSP50747 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLCSP50747 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLCSP50747 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLCSP50747 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLCSP50747 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLCSP50747 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLCSP50747 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HLCSP50747 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLCSP50747 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLCSP50747 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLCSP50747 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLCSP50747 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLCSP50747 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLCSP50747 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLCSP50747 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HLCSP50747 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLCSP50747 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLCSP50747 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLCSP50747 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HLCSP50747 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLCSP50747 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLCSP50747 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HLCSP50747 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLCSP50747 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HLCSP50747 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLCSP50747 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLCSP50747 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLCSP50747 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLCSP50747 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLCSP50747 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLCSP50747 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLCSP50747 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLCSP50747 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLCSP50747 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLCSP50747 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLCSP50747 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLCSP50747 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLCSP50747 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLCSP50747 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLCSP50747 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLCSP50747 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
HLCSP50747 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms