Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ETV1P50549 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ETV1P50549 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ETV1P50549 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ETV1P50549 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ETV1P50549 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ETV1P50549 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ETV1P50549 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ETV1P50549 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ETV1P50549 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ETV1P50549 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ETV1P50549 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ETV1P50549 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ETV1P50549 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ETV1P50549 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ETV1P50549 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ETV1P50549 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ETV1P50549 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ETV1P50549 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ETV1P50549 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ETV1P50549 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ETV1P50549 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ETV1P50549 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ETV1P50549 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ETV1P50549 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ETV1P50549 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ETV1P50549 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ETV1P50549 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ETV1P50549 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ETV1P50549 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ETV1P50549 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ETV1P50549 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ETV1P50549 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ETV1P50549 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ETV1P50549 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ETV1P50549 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ETV1P50549 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ETV1P50549 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETV1P50549 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETV1P50549 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETV1P50549 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETV1P50549 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETV1P50549 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETV1P50549 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETV1P50549 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETV1P50549 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETV1P50549 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETV1P50549 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETV1P50549 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETV1P50549 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETV1P50549 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETV1P50549 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETV1P50549 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETV1P50549 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETV1P50549 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETV1P50549 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETV1P50549 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ETV1P50549 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETV1P50549 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETV1P50549 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETV1P50549 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETV1P50549 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETV1P50549 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETV1P50549 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ETV1P50549 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETV1P50549 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETV1P50549 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETV1P50549 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETV1P50549 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETV1P50549 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETV1P50549 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETV1P50549 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETV1P50549 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ETV1P50549 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETV1P50549 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETV1P50549 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETV1P50549 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETV1P50549 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETV1P50549 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETV1P50549 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETV1P50549 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETV1P50549 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETV1P50549 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETV1P50549 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETV1P50549 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ETV1P50549 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETV1P50549 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETV1P50549 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETV1P50549 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETV1P50549 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETV1P50549 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETV1P50549 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETV1P50549 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETV1P50549 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETV1P50549 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETV1P50549 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ETV1P50549 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ETV1P50549 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ETV1P50549 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ETV1P50549 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms