Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GSK3BP49841 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSK3BP49841 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms