Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NUP153P49790 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC37.85■■■■□ 3.65
NUP153P49790 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
NUP153P49790 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NUP153P49790 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NUP153P49790 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
NUP153P49790 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
NUP153P49790 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
NUP153P49790 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NUP153P49790 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
NUP153P49790 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
NUP153P49790 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
NUP153P49790 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
NUP153P49790 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
NUP153P49790 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
NUP153P49790 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
NUP153P49790 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
NUP153P49790 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
NUP153P49790 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NUP153P49790 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
NUP153P49790 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NUP153P49790 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NUP153P49790 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NUP153P49790 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
NUP153P49790 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NUP153P49790 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
NUP153P49790 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NUP153P49790 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NUP153P49790 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NUP153P49790 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NUP153P49790 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NUP153P49790 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NUP153P49790 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NUP153P49790 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NUP153P49790 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NUP153P49790 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
NUP153P49790 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
NUP153P49790 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
NUP153P49790 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
NUP153P49790 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NUP153P49790 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NUP153P49790 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NUP153P49790 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC37.74■■■■□ 3.63
NUP153P49790 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NUP153P49790 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NUP153P49790 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
NUP153P49790 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NUP153P49790 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NUP153P49790 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NUP153P49790 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NUP153P49790 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NUP153P49790 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NUP153P49790 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NUP153P49790 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NUP153P49790 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NUP153P49790 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NUP153P49790 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NUP153P49790 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NUP153P49790 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NUP153P49790 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NUP153P49790 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NUP153P49790 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
NUP153P49790 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
NUP153P49790 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NUP153P49790 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NUP153P49790 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
NUP153P49790 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
NUP153P49790 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NUP153P49790 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NUP153P49790 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NUP153P49790 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NUP153P49790 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NUP153P49790 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NUP153P49790 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NUP153P49790 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NUP153P49790 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NUP153P49790 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NUP153P49790 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NUP153P49790 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NUP153P49790 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
NUP153P49790 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NUP153P49790 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
NUP153P49790 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
NUP153P49790 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NUP153P49790 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
NUP153P49790 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
NUP153P49790 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
NUP153P49790 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NUP153P49790 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NUP153P49790 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NUP153P49790 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NUP153P49790 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NUP153P49790 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
NUP153P49790 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NUP153P49790 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
NUP153P49790 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NUP153P49790 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
NUP153P49790 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NUP153P49790 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
NUP153P49790 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms