Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NRIP1P48552 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NRIP1P48552 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRIP1P48552 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms