Protein–RNA interactions for Protein: P47804

RGR, RPE-retinal G protein-coupled receptor, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGRP47804 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGRP47804 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGRP47804 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGRP47804 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGRP47804 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGRP47804 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGRP47804 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGRP47804 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGRP47804 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGRP47804 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGRP47804 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGRP47804 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGRP47804 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGRP47804 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGRP47804 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGRP47804 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RGRP47804 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGRP47804 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGRP47804 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGRP47804 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGRP47804 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGRP47804 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGRP47804 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGRP47804 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGRP47804 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGRP47804 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGRP47804 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGRP47804 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGRP47804 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGRP47804 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGRP47804 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGRP47804 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGRP47804 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGRP47804 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGRP47804 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGRP47804 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGRP47804 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGRP47804 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGRP47804 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGRP47804 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGRP47804 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGRP47804 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGRP47804 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGRP47804 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGRP47804 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGRP47804 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGRP47804 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RGRP47804 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGRP47804 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGRP47804 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGRP47804 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGRP47804 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGRP47804 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGRP47804 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGRP47804 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGRP47804 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGRP47804 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RGRP47804 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGRP47804 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RGRP47804 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGRP47804 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGRP47804 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGRP47804 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGRP47804 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RGRP47804 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGRP47804 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGRP47804 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGRP47804 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RGRP47804 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGRP47804 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGRP47804 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RGRP47804 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGRP47804 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGRP47804 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGRP47804 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGRP47804 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGRP47804 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGRP47804 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGRP47804 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGRP47804 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGRP47804 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGRP47804 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RGRP47804 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGRP47804 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGRP47804 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGRP47804 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGRP47804 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGRP47804 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGRP47804 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGRP47804 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGRP47804 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGRP47804 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGRP47804 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGRP47804 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGRP47804 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGRP47804 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGRP47804 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGRP47804 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGRP47804 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGRP47804 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms