Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RECQLP46063 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RECQLP46063 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RECQLP46063 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RECQLP46063 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RECQLP46063 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RECQLP46063 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RECQLP46063 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RECQLP46063 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RECQLP46063 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RECQLP46063 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RECQLP46063 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RECQLP46063 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RECQLP46063 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RECQLP46063 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RECQLP46063 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RECQLP46063 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RECQLP46063 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RECQLP46063 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RECQLP46063 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RECQLP46063 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RECQLP46063 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RECQLP46063 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RECQLP46063 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RECQLP46063 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RECQLP46063 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RECQLP46063 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RECQLP46063 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RECQLP46063 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RECQLP46063 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RECQLP46063 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RECQLP46063 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RECQLP46063 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RECQLP46063 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RECQLP46063 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RECQLP46063 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RECQLP46063 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RECQLP46063 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RECQLP46063 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RECQLP46063 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RECQLP46063 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RECQLP46063 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RECQLP46063 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RECQLP46063 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RECQLP46063 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RECQLP46063 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RECQLP46063 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RECQLP46063 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RECQLP46063 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RECQLP46063 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RECQLP46063 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RECQLP46063 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RECQLP46063 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RECQLP46063 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RECQLP46063 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RECQLP46063 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RECQLP46063 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RECQLP46063 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RECQLP46063 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RECQLP46063 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RECQLP46063 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RECQLP46063 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RECQLP46063 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RECQLP46063 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RECQLP46063 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RECQLP46063 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RECQLP46063 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RECQLP46063 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RECQLP46063 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RECQLP46063 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RECQLP46063 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RECQLP46063 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RECQLP46063 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RECQLP46063 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RECQLP46063 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RECQLP46063 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RECQLP46063 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RECQLP46063 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RECQLP46063 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RECQLP46063 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RECQLP46063 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RECQLP46063 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RECQLP46063 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RECQLP46063 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RECQLP46063 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RECQLP46063 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RECQLP46063 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RECQLP46063 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RECQLP46063 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RECQLP46063 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RECQLP46063 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RECQLP46063 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RECQLP46063 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RECQLP46063 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RECQLP46063 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RECQLP46063 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RECQLP46063 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RECQLP46063 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RECQLP46063 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RECQLP46063 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms