Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCG1P45844 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCG1P45844 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCG1P45844 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms