Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCAMP43121 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCAMP43121 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCAMP43121 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCAMP43121 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MCAMP43121 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCAMP43121 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCAMP43121 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCAMP43121 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCAMP43121 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCAMP43121 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCAMP43121 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCAMP43121 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCAMP43121 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
MCAMP43121 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
MCAMP43121 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCAMP43121 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCAMP43121 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCAMP43121 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCAMP43121 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCAMP43121 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCAMP43121 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCAMP43121 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCAMP43121 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCAMP43121 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCAMP43121 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCAMP43121 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCAMP43121 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCAMP43121 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MCAMP43121 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
MCAMP43121 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MCAMP43121 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MCAMP43121 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MCAMP43121 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MCAMP43121 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCAMP43121 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCAMP43121 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCAMP43121 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCAMP43121 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCAMP43121 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCAMP43121 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCAMP43121 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
MCAMP43121 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCAMP43121 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCAMP43121 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCAMP43121 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCAMP43121 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCAMP43121 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCAMP43121 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCAMP43121 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCAMP43121 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCAMP43121 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCAMP43121 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCAMP43121 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCAMP43121 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCAMP43121 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCAMP43121 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCAMP43121 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCAMP43121 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
MCAMP43121 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCAMP43121 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCAMP43121 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCAMP43121 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCAMP43121 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCAMP43121 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCAMP43121 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MCAMP43121 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MCAMP43121 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MCAMP43121 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MCAMP43121 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MCAMP43121 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MCAMP43121 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MCAMP43121 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MCAMP43121 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
MCAMP43121 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCAMP43121 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCAMP43121 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCAMP43121 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCAMP43121 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCAMP43121 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MCAMP43121 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MCAMP43121 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MCAMP43121 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MCAMP43121 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29■■■□□ 2.23
MCAMP43121 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MCAMP43121 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MCAMP43121 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MCAMP43121 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCAMP43121 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCAMP43121 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCAMP43121 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCAMP43121 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCAMP43121 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCAMP43121 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCAMP43121 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCAMP43121 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCAMP43121 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCAMP43121 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCAMP43121 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCAMP43121 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms