Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3CAP42336 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms