Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC26A3P40879 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC26A3P40879 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC26A3P40879 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms