Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PBX1P40424 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PBX1P40424 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PBX1P40424 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PBX1P40424 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PBX1P40424 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PBX1P40424 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PBX1P40424 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PBX1P40424 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PBX1P40424 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PBX1P40424 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PBX1P40424 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PBX1P40424 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PBX1P40424 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PBX1P40424 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PBX1P40424 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PBX1P40424 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PBX1P40424 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PBX1P40424 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PBX1P40424 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PBX1P40424 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PBX1P40424 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PBX1P40424 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PBX1P40424 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PBX1P40424 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PBX1P40424 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PBX1P40424 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PBX1P40424 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PBX1P40424 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PBX1P40424 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PBX1P40424 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PBX1P40424 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PBX1P40424 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PBX1P40424 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PBX1P40424 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PBX1P40424 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PBX1P40424 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PBX1P40424 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PBX1P40424 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PBX1P40424 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PBX1P40424 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PBX1P40424 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PBX1P40424 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PBX1P40424 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PBX1P40424 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PBX1P40424 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PBX1P40424 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PBX1P40424 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PBX1P40424 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PBX1P40424 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PBX1P40424 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PBX1P40424 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PBX1P40424 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PBX1P40424 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PBX1P40424 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PBX1P40424 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBX1P40424 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBX1P40424 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBX1P40424 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBX1P40424 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBX1P40424 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBX1P40424 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBX1P40424 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBX1P40424 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PBX1P40424 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBX1P40424 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBX1P40424 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBX1P40424 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PBX1P40424 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBX1P40424 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBX1P40424 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBX1P40424 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBX1P40424 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBX1P40424 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBX1P40424 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PBX1P40424 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PBX1P40424 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PBX1P40424 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PBX1P40424 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PBX1P40424 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PBX1P40424 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PBX1P40424 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PBX1P40424 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PBX1P40424 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PBX1P40424 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PBX1P40424 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PBX1P40424 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PBX1P40424 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PBX1P40424 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PBX1P40424 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PBX1P40424 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PBX1P40424 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PBX1P40424 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PBX1P40424 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PBX1P40424 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PBX1P40424 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PBX1P40424 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PBX1P40424 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PBX1P40424 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PBX1P40424 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms